甘南州卫生学校1979年建校，承担全州中初级医疗卫计人才的培养培训和职业技能鉴定任务，2006年评定为“省级重点中等职业学校”，2010年晋升为“国家级重点中等职业学校”。甘肃中医药大学藏医学院是全国开办藏医药高等教育的三所高校之一，其发展经历了两个阶段，第一阶段是甘南州人民政府和甘肃中医学院于1989年在我校中专藏医士专业基础上举办藏医系，这个阶段，只开办藏医学专业大专教育，共培养了十一届学生；第二阶段从2001年起，藏医系扩大为藏医学院并实现快速发展，不仅增设了藏药学专科专业，藏医学专科专业也升格至本科，并于2006年获得硕士学位授予权，2013年开始招收藏医学硕士研究生；同在2013年，藏药学专科专业升格到本科并于2017年获学士学位授予权。
目前，学校加挂甘肃中医药大学藏医学院、甘南州第八国家职业技能鉴定所、甘南州全科医生培训基地等六块牌子。中专部开设普通中等专业农村医学、护理、医学检验、口腔工艺技术、药剂等5个，其中护理专业为省级示范专业；藏医学院开设五年制藏医学本科、四年制藏药学本科专业两个，其中藏医学专业2016年被评为甘肃省高等教育特色专业并设有硕士学位教学点。另外，学校还承担甘南州卫生健康系统“乡村医师培训”、“全科医生培训”、“西学中”培训和“中藏医适宜技术培训”、基层卫生人员能力提升培训任务5种，累计培训2300余人次；另开展育婴员、保健按摩师、养老护理、病房护士和社区护士职业技能鉴定工种5个，累计培训鉴定中级国家职业技能资格1000余人次。学校整体办学基本形成以藏医学本科教育为特色，普通中等医学教育为基础，成人高等教育为补充，中专、大专、本科并举，藏医药、西医药并重，普教、成教、培训协同发展的多元化格局。
学校总占地71.11亩，现有校舍建筑面40000余平方米。固定资产近1亿元，图书4万余册，订阅各类报刊杂志260余种。在州内外拥有20余家教学实习医院。配备解剖、三理、临床技能、外妇、中心、基护、病理、口腔、藏药标本、藏药炮制、护理实训等31个实验室，重点发展和引进现代医学新技术，建设开放型、能够满足各专业实验教学需要、融合多学科的现代化高水平实验教学平台，积极应用于各专业实践教学之中。目前，正在建设和筹建的还有护理礼仪室、藏医史展室、人体生命展馆、青藏高原药用动植物标本展馆等，建成后将使我校的实验实训教学迈上一个新的台阶。2017年，我校根据发展需要，修订校园了建设规划，计划征地43亩，新建卫建干部培训中心、2号实训楼、综合教学楼、综合办公楼、风雨操场等设施并积极申报项目建设计划，待陆续实施以后，将极大地改善我校的办学条件，为下一步发展奠定良好的硬件基础。
学校在职教职工124人，其中专业技术人员94人，管理人员17人，工勤人员13人。专任教师中博士研究生1名，硕士研究生7名，本科72人，职称结构为正高级讲师1人，副高级讲师34人，讲师及以下37人。管理人员中正县级1人，副县级1人。截止目前，有教学班本科13个、中职17个，在校学生近1300余人。
近5年来，我校（院）教师申报并主持完成专业科研项目6个，获省部级奖励1项，获得厅局级奖励13项；申报并获批甘肃中医药大学校级精品课程1项、优秀教学团队2项、省级精品课程1项。由学校教师主编、参编藏医学专科自编教材17种，编写完成面向21世纪藏医学本科教材3种，承担编译面向新世纪课程系列教材3种，与青海医学院联合编写藏药本科教材7种，出版专著5部；主编、参编中职教育教材20余种；在国家级、省级刊物发表教研论文300余篇。
今年，甘南州卫生学校迎来建校40周年、藏医学院迎来办学30周年。总结办学成果，我们学校（学院）累计培养了7000余名中专层次医疗卫生人才和1000余名藏医药高等专业技术人才，扎根在我省甘南州、天祝县及青海、四川等地的医疗、科研、教学、预防、保健等行业领域，许多人已成为本行业领域中的骨干力量，有力地促进了地区卫生事业和经济社会的全面发展，也成为了传承和推动藏医药事业不断发展的重要力量。当前甘南州卫生专业技术人员中由甘南卫校、藏医学院培养的占80%以上。
新形势下，学校全面贯彻国家职业教育改革精神，主动为提高学生就业能力服务，积极打通中高职升学通道，先后与武威职业学院、酒泉职业技术学院、平凉职业技术学院签订了“五年一贯制”及“对口单独考试招生”等合作办学协议，并鼓励学生通过“三校生考试”“推荐免试”“职业技能鉴定”等渠道提升学历，提高“双证”持证率，拓宽就业门路。经过综合施策，学校中职学生升学率、就业率逐年提高，办学质量和效益长期居于全州前列。
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